污水處理站在進行廢水處理過程中，在微生物氧化分解過程中，含硫/氮等有機物也會產生二次污染物，其二次污染物閥值較低，在常溫下均會散發出陣陣的惡臭，感觀效應差。

　　污水處理廠的進水提升泵房產生的主要臭氣為硫化氫，初沉淀池污泥厭氧清化過程中產生的臭氣以硫化氫及其他含硫氣體為主，污泥消化穩定過程中會產生氮氣和其他易揮發物質。垃圾堆肥過程中會產生氨氣、胺、硫化物、脂肪酸、芳香族和二甲基硫等臭氣。好氧化及污泥風干過程可能產生少量的硫化氫，但主要有硫醇和二甲基硫氣體產生。主要惡臭物質如下。

　　1、氨氣

　　氨氣在污水中的濃度通常不高，主要由污水中的固體顆粒經過厭氧消化和好氧消化面產生。

　　2、硫醇

　　硫醇和其他含硫的污水氣態化合物(如甲基二硫化物、二甲基二硫化物）由于在低濃度極限時也可以產生強烈的惡臭，而成為污水處理廠惡臭控制的難點。這些含硫氣態化合物和硫化氫產生的途徑相同，且存在于同樣的廢氣中。

　　3、VFAs(揮發性脂肪酸)

　　VFAs是有機物在缺氧或厭氧條件下分解產生的，包括丁酸(臭黝味）、乙酸（醋）和丙酸。它們的特點是惡臭閥值低，強度大、VFAs是由污泥和污水的分解產生的。在整個處理廠內，只要是氧氣濃度低或為零且pH值相對較低的地方，都可能產生VFAs.

　　4、VOCs(揮發性有機化合物)

　　VOCs包括一系列合成和自然生成的有機化合物，有些是惡臭的，有些是氣態有毒物。它們大多數來自工業污染源，且通常是不能進行生物降解的。污水處理工藝中攪動的地方可以揮發出VOCs。